维普查重系统主要用于学术论文、期刊等科研领域，而不是专门设计用于软件著作权（软著）说明文件。软著说明文件通常是用于提交软著申请的文档，其性质和格式可能与学术论文有所不同。

维普查重系统主要用于检测学术文献的相似性和抄袭情况，采用的算法和匹配策略更侧重于学术领域的文本相似性。软著说明文件通常包含了软件的功能描述、技术特点、创新点等，而这些内容与学术论文可能存在较大的差异。

计算机软件著作权申请是经过形式审查的程序，不涉及查重或实质审查。只需确保资料完整、格式符合规范，即可顺利办理登记。软著的保护对象是源代码，如果有他人申请的源代码与自己的完全相同，可采取维权措施。获得版权登记证书是有力的维权证据，能证明登记、软件完成和发表的时间。另外，软件名称允许与他人相同。

因此，对于软著说明文件，使用维普查重系统可能并不是最合适的选择，因为这类文件的特点可能不符合维普查重系统的设计目的。对于软著说明文件，更适合的查重工具可能是专门设计用于技术文档、说明文件的查重系统，或者一些通用的查重工具，以确保软件著作权的申请材料的原创性和合规性。